Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms