Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRNP1Q6NT89 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms