Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL3Q6DD88 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms