Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT39Q6A163 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms