Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3L3Q68CJ9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms