Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CLQ60I27 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms