Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHEQ5VZ18 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms