Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF20Q5VTR2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF20Q5VTR2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms