Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR78Q5VTH9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms