Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EEF1A1P5Q5VTE0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EEF1A1P5Q5VTE0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms