Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms