Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C12orf60Q5U649 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms