Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC183Q5T5S1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms