Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf220Q5T0J3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms