Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms