Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47A1Q5JQC4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms