Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COBLL1Q53SF7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms