Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAN2Q504Q3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAN2Q504Q3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms