Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GREB1Q4ZG55 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms