Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3L2Q3SX64 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms