Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EDRF1Q3B7T1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDRF1Q3B7T1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms