Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms