Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIF4BQ2VIQ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF4BQ2VIQ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4BQ2VIQ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms