Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
FHOD3Q2V2M9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
FHOD3Q2V2M9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FHOD3Q2V2M9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms