Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL40Q2TBA0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms