Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPEL1Q2QD12 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms