Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC6LQ2NKX8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms