Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTC1Q2NKJ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTC1Q2NKJ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms