Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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