Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF2Q1L5Z9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF2Q1L5Z9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms