Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRF1Q16656 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms