Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2Q16621 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2Q16621 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NFE2Q16621 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NFE2Q16621 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2Q16621 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFE2Q16621 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms