Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CARTPTQ16568 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CARTPTQ16568 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms