Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms