Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED1Q15648 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED1Q15648 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED1Q15648 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MED1Q15648 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MED1Q15648 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED1Q15648 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED1Q15648 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED1Q15648 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED1Q15648 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED1Q15648 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED1Q15648 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED1Q15648 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED1Q15648 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED1Q15648 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED1Q15648 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED1Q15648 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED1Q15648 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MED1Q15648 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MED1Q15648 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MED1Q15648 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MED1Q15648 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MED1Q15648 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED1Q15648 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED1Q15648 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MED1Q15648 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MED1Q15648 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MED1Q15648 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MED1Q15648 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MED1Q15648 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED1Q15648 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED1Q15648 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MED1Q15648 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED1Q15648 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED1Q15648 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED1Q15648 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED1Q15648 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MED1Q15648 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms