Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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TRIP11Q15643 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms