Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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