Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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