Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCOLCEQ15113 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PCOLCEQ15113 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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