Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHD4Q14839 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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