Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD11Q14690 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD11Q14690 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD11Q14690 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD11Q14690 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms