Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SQLEQ14534 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SQLEQ14534 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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