Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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COL9A2Q14055 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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