Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGB1Q14028 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNGB1Q14028 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB1Q14028 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms