Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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