Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTCH1Q13635 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
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