Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL1Q13616 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL1Q13616 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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