Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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