Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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