Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LSAMPQ13449 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LSAMPQ13449 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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